La estructura organizacional de EMEESA E.S.P. inicia en la Asamblea General de Accionistas. Esta tiene el apoyo de la Junta directiva, que cuenta con la Asesoría Jurídica, Revisor Fiscal, la estructura inicial designa un Gerente principal para la representación legal de la Empresa Municipal de Energía Eléctrica el cual es apoyado por, la Asesoría Planeación y Estudios, Asesoría de Sistemas, asesoría de Gestión Ambiental. Y a la vez por, un jefe de planta el cual está bajo su mando, los operadores, bocatomeros, y obreros. Un ingeniero electricista el cual tiene bajo su mando los técnicos electricista y el conductor el cual debe ser técnico electricista. Un ingeniero Comercial. Un auxiliar de Facturación. Un contador el cual está bajo su mando una auxiliar contable. Un auxiliar administrativo el cual está bajo su mando un auxiliar de archivo y una persona de servicios generales.